Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spocd1B1ASB6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms