Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms