Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef20B1ARV6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms