Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M5A7VMS3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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