Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AI481877A2ALV5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AI481877A2ALV5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms