Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms