Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms