Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39aA2ACP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttc39aA2ACP1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc39aA2ACP1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms