Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms