Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm16A2A935 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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