Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calcoco2A2A6M5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms