Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo47A2A6H3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms