Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms