Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdfS4R2K0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdfS4R2K0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms