Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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Hdac5Q9Z2V6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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