Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Knop1Q9Z2Q2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms