Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms