Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms