Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog1Q9Z160 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog1Q9Z160 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms