Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NgfrQ9Z0W1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms