Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd97Q9Z0M6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd97Q9Z0M6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms