Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nme4Q9WV84 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms