Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdh13Q9WTR5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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