Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc2Q9R244 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms