Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms