Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod1Q9R0E2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms