Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tk2Q9R088 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms