Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BcamQ9R069 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcamQ9R069 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms