Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms