Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copg1Q9QZE5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms