Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms