Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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