Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms