Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndrg3Q9QYF9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms