Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VapbQ9QY76 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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