Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf3Q9QXK7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms