Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Limd1Q9QXD8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Limd1Q9QXD8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Limd1Q9QXD8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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