Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyth1Q9QX11 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms