Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-OaQ9QWV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms