Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms