Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trappc2lQ9JME7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms