Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkap1Q9JMB0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms