Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Prg4Q9JM99 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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