Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms