Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tgm1Q9JLF6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm1Q9JLF6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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