Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms