Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx5Q9JL61 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms