Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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