Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Mrpl39Q9JKF7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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