Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin1Q9JKF6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms